Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Mis12Q9CY25 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms