Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY21

Bud23, Probable 18S rRNA (guanine-N(7))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bud23Q9CY21 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bud23Q9CY21 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bud23Q9CY21 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bud23Q9CY21 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bud23Q9CY21 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Bud23Q9CY21 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Bud23Q9CY21 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Bud23Q9CY21 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Bud23Q9CY21 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bud23Q9CY21 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms