Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nip7Q9CXK8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Nip7Q9CXK8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms