Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE0

Prdm5, PR domain zinc finger protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm5Q9CXE0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Prdm5Q9CXE0 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Prdm5Q9CXE0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prdm5Q9CXE0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prdm5Q9CXE0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prdm5Q9CXE0 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prdm5Q9CXE0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Prdm5Q9CXE0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Prdm5Q9CXE0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Prdm5Q9CXE0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Prdm5Q9CXE0 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Prdm5Q9CXE0 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prdm5Q9CXE0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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