Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Utp23Q9CX11 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Utp23Q9CX11 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms