Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cxxc1Q9CWW7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cxxc1Q9CWW7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms