Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW6

Pin4, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase NIMA-interacting 4, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin4Q9CWW6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Pin4Q9CWW6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Pin4Q9CWW6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms