Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prkrip1Q9CWV6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prkrip1Q9CWV6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms