Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atxn3Q9CVD2 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atxn3Q9CVD2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms