Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MINDY3Q9CV28 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MINDY3Q9CV28 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms