Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
4930519P11RikQ9CUJ8 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms