Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
4930535I16RikQ9CUI2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
4930535I16RikQ9CUI2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms