Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
4930553M12RikQ9CUH1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930553M12RikQ9CUH1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms