Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTG6

Atp13a2, Cation-transporting ATPase 13A2, mousemouse

Predictions only

Length 1,169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a2Q9CTG6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atp13a2Q9CTG6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp13a2Q9CTG6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms