Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rprd1bQ9CSU0 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rprd1bQ9CSU0 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms