Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pard3bQ9CSB4 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Pard3bQ9CSB4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms