Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
4931417E11RikQ9CR05 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
4931417E11RikQ9CR05 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms