Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Atg12Q9CQY1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.9 ms