Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX5

Cldnd1, Claudin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldnd1Q9CQX5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldnd1Q9CQX5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldnd1Q9CQX5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldnd1Q9CQX5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cldnd1Q9CQX5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cldnd1Q9CQX5 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms