Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ykt6Q9CQW1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms