Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rwdd1Q9CQK7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rwdd1Q9CQK7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms