Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF3

Nudt21, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudt21Q9CQF3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nudt21Q9CQF3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms