Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rab5aQ9CQD1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Rab5aQ9CQD1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms