Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpa3Q9CQ71 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rpa3Q9CQ71 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms