Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Bhlhe41Q99PV5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bhlhe41Q99PV5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms