Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gtf2a1Q99PM3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtf2a1Q99PM3 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms