Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup155Q99P88 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup155Q99P88 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup155Q99P88 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup155Q99P88 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup155Q99P88 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup155Q99P88 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup155Q99P88 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nup155Q99P88 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Nup155Q99P88 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Nup155Q99P88 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.2 ms