Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rassf3Q99P51 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Rassf3Q99P51 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Rassf3Q99P51 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms