Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gtf2ird2Q99NI3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms