Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rims1Q99NE5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rims1Q99NE5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms