Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acss1Q99NB1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms