Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SrrtQ99MR6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SrrtQ99MR6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms