Protein–RNA interactions for Protein: Q99MK9

Rassf1, Ras association domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf1Q99MK9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf1Q99MK9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf1Q99MK9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf1Q99MK9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf1Q99MK9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf1Q99MK9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf1Q99MK9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rassf1Q99MK9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rassf1Q99MK9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms