Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Nkd1Q99MH6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Nkd1Q99MH6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms