Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PtprtQ99M80 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PtprtQ99M80 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PtprtQ99M80 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
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