Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gdpd3Q99LY2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gdpd3Q99LY2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms