Protein–RNA interactions for Protein: Q99LS3

Psph, Phosphoserine phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsphQ99LS3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
PsphQ99LS3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PsphQ99LS3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms