Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rcbtb2Q99LJ7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rcbtb2Q99LJ7 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms