Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RtcbQ99LF4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RtcbQ99LF4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms