Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Abcf2Q99LE6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms