Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pagr1aQ99L02 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pagr1aQ99L02 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms