Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99KU6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99KU6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99KU6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99KU6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99KU6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99KU6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99KU6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99KU6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99KU6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Q99KU6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99KU6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99KU6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99KU6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99KU6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99KU6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99KU6 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99KU6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99KU6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99KU6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Q99KU6 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q99KU6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q99KU6 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q99KU6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q99KU6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q99KU6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q99KU6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q99KU6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q99KU6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q99KU6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms