Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Prpf19Q99KP6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Prpf19Q99KP6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms