Protein–RNA interactions for Protein: Q99KK1

Reep3, Receptor expression-enhancing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Reep3Q99KK1 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Reep3Q99KK1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Reep3Q99KK1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms