Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlgn1Q99K10 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlgn1Q99K10 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms