Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Higd1bQ99JY6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Higd1bQ99JY6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms