Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Klhl22Q99JN2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Klhl22Q99JN2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms