Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf112Q96DY5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf112Q96DY5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms