Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn16Q925N4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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