Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PdgfdQ925I7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PdgfdQ925I7 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms